故事發(fā)生在誠(chéng)教學(xué)園初中部，由于歷史悠久的緣故，許多不思議事件在校園中廣為流傳。某日，少年新谷真一迷失在了猶如迷宮一般的校舍之間，夕陽(yáng)下，一個(gè)黑發(fā)少女的身影出現(xiàn)在了他的視線中。少女穿著真一沒(méi)有見(jiàn)過(guò)的古老校服，空洞的眼神里充滿(mǎn)了哀怨。難道，我遇見(jiàn)了幽靈？真一興奮的這樣想著。
原來(lái)，幽靈少女名叫庚夕子，15歲那年不幸去世，因?yàn)槭チ擞洃?，因此也想不起?lái)究竟是如何死去的，為此苦惱的夕子這才每日徘徊在校園之中，成為了眾多靈異事件的始作俑者。作為唯一能夠看見(jiàn)夕子存在的人，真一成為了尋找夕子記憶的頭號(hào)人選，一個(gè)名為“靈異調(diào)查部”的社團(tuán)就這樣成立了。