為了成為合格的神奇寶貝訓(xùn)練師，小智（松本梨香 配音）、天桐（宮野真 配音）、艾莉絲（悠木碧 配音）帶著各自的小伙伴繼續(xù)在世界各地旅行。這次他們來(lái)到了美麗的山中小鎮(zhèn)艾茵多奧克參加神奇寶貝的比賽，在比賽的時(shí)候，小智多次得到一個(gè)神秘的小家伙的幫助。他的反常舉動(dòng)引起了當(dāng)?shù)氐拿利惻⒖ɡ蛩淖⒁?，最終眾人發(fā)現(xiàn)，那個(gè)幫助了小智的家伙就是傳說(shuō)中擁有神奇力量的神奇寶貝比克提尼（水樹(shù)奈奈 配音）。
　　早在一千多年前，艾茵多奧克所在的土地上有一個(gè)美麗富饒的大地之鄉(xiāng)，可是兩個(gè)王子的爭(zhēng)斗摧毀了這個(gè)國(guó)家的寧?kù)o。老國(guó)王借助比克提尼的力量暫時(shí)穩(wěn)定住了龍脈，而大地之鄉(xiāng)則從此衰敗。作為古國(guó)的后裔，卡莉塔的哥哥德雷多（つるの剛士 配音）決定依靠比克提尼重建大地之鄉(xiāng)……