上篇中，夜神月（藤原龍也 飾）設(shè)計(jì)除掉了女友和跟蹤自己的FBI的探員，趁機(jī)混進(jìn)了調(diào)查本部，但是，L（松山健一 飾）對(duì)他的懷疑并沒(méi)有結(jié)束，新一輪的智力游戲繼續(xù)進(jìn)行。
 與死神硫克個(gè)性迥異的死神雷姆把另外一本“死亡筆記”扔到人間，得到它的是極度崇拜“基拉”的少女彌海砂（戶田惠梨香 飾），她還以一半性命為代價(jià)得到了夜神月所沒(méi)有的死神之眼。并主動(dòng)和夜神月聯(lián)系，答應(yīng)協(xié)助他除掉L，條件是讓月做自己的男朋友。聰明的L先發(fā)制人，將彌海砂關(guān)進(jìn)了基拉對(duì)策室，夜神月為了救彌海砂，也為了自保，想到了一個(gè)絕妙的辦法。
 同時(shí)，因?yàn)楦檲?bào)道“基拉”事件而風(fēng)頭大勁的櫻花電視臺(tái)發(fā)生了一連出人意料的事情，主播高田清美（片瀨那奈 飾）追蹤基拉的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)了不為人知的秘密，隨即第三名基拉出現(xiàn)了......
 兩個(gè)死神，兩本“死亡筆記”，三個(gè)基拉，一切撲朔迷離；兩個(gè)算無(wú)遺漏的天才，誰(shuí)最終能夠洞悉事實(shí)的真相？誰(shuí)才是“死亡筆記”上最后的名字？